Kit hoạt động dựa trên đồng thời nhiều đầu dò Taqman kết hợp với đoạn mồi giúp khuếch đại đoạn gen đặc hiệu để phát hiện vi khuẩn trong các mẫu thử khác nhau. Từ đó, đọc kết quả dựa vào tín hiệu huỳnh quang tiết kiệm thời gian và tránh nguy cơ ngoại nhiễm khi không cần trải qua bước điện di.
Quy trình gồm 4 bước chính: (i) Xử lý mẫu (bước tăng sinh); (ii) Tách chiết DNA; (iii) Khuếch đại các trình tự đích bằng realtime PCR; (iv) Phân tích kết quả.
Tổng quy trình thực hiện từ 9 đến 24 giờ (tùy thuộc thời gian tăng sinh)
Xử lý mẫu (tăng sinh 6-24h)
Mục đích: cung cấp môi trường và điều kiện thuận lợi để Salmonella spp tăng sinh (nếu có) trong nền mẫu thử.
Tách chiết DNA (30 phút)
Mục đích: Thu nhận DNA vi khuẩn mục tiêu (nếu có) bằng phương pháp nhiệt. Quá trình đun sôi và tác động của dung dịch tách chiết sẽ giúp phá vỡ cấu trúc tế bào và giải phóng DNA. Ly tâm tốc độ cao giúp thu được DNA trong dịch nổi, được đem dùng trong phản ứng multiplex realtime PCR.
Multiplex realtime PCR (1h40p)
Mục đích: Khuếch đại trình tự DNA mục tiêu (nếu có) trong mẫu, để từ đó phát hiện sự hiện diện của vi khuẩn mục tiêu. Đoạn DNA này là đặc hiệu, chuyên biệt và bảo tồn của vi khuẩn mục tiêu cần phát hiện.
Đọc kết quả (15 phút)
Nguyên lý: Dựa vào tương tác giữa đầu dò Taqman và emzyme Taq polymerase trong quá trình nhân đôi mà sự gia tăng số lượng sản phẩm PCR được theo dõi theo thời gian thực thông qua tín hiệu huỳnh quang được phát ra tương ứng. Mẫu có DNA mục tiêu thì tín hiệu quang phát ra mạnh và vượt ngưỡng tín hiệu.